Toni és Guardiola jól ismerik egymást, 2001-től 2003-ig klubtársak voltak a Bresciánál. A katalán szakember az egykori olasz válogatott csatárt faggatta, mielőtt aláírt volna a Bayern Münchenhez.
"Néhányszor felhívott és a Bayern Münchenről beszélgettünk, megkérdezte, milyen volt a klub, amikor ott játszottam - mesélte Toni. - Ekkor már tudtam, hogy a bajor csapathoz tart. A Bayern fantasztikus egyesült, remek döntés volt Guardiola részéről, hogy a münchenieket választotta. Ő és a klub is jól jár. A Bayern megkapta a világ egyik legjobb edzőjét. Szerintem Guardiola képes lehet Európa legjobb csapatává formálni a Bayern Münchent."
Toni 2007-től 2010-ig játszott a Bayernnél, egy bajnoki címet és egy Német Kupát nyert a gárdával.